本科论文的万方查重费用与学科之间确实存在一定的关联。不同学科的本科论文在撰写难度、查重程度等方面可能存在差异，因此万方查重费用也会因学科而异。一般来说，理工类学科的本科论文查重费用可能会相对较高，因为这类论文往往涉及到大量的数据分析和实验验证，需要更严格的查重。而文科类学科的本科论文可能相对较低，因为其研究对象和方法相对灵活，查重要求相对较低。因此，本科论文万方查重费用与学科之间的关系是存在的。

除了学科的不同，本科论文万方查重费用还受到其他因素的影响，如论文的篇幅、研究深度、参考文献使用等。在选择万方查重服务时，建议根据自身的学科特点和论文要求进行综合考量，以确保获得准确有效的查重结果。此外，也可以通过咨询相关专业人士或机构，获取针对性的建议和指导，帮助降低本科论文查重费用并提高查重通过率。