万方本科查重费用通常是指在万方数据库进行学位论文查重所需的费用，一般根据检测的篇数和相似度等因素来确定收费标准。而多次查重则是指同一篇论文可以进行多次查重，以确保论文的原创性和学术诚信。在费用方面，多次查重可能会有一定的优惠政策，但具体情况需要根据各家机构的规定而定。

此外，万方本科查重费用与多次查重在服务内容上也有所不同。万方本科查重费用主要关注于提供一次性的查重报告，而多次查重则更注重于帮助作者不断优化论文，提高论文的质量。因此，选择万方本科查重还是多次查重，取决于您对论文查重的需求和预算情况。